La Conferencia Anual, representa uno de los eventos centrales que organiza la Asociación a lo largo del año, el principal objetivo es brindar información sobre tendencias en el área escolar y exponer buenas prácticas que sirvan de ejemplo a los miembros de la ARSEE y a personas en general que laboran en las áreas de la administración escolar.

Los temas que se abordan de manera anual centran atención en la importancia de contribuir a mejorar la calidad de las instituciones de educación media superior y de educación superior a través de sus áreas de Servicios Escolares que son el pilar de la seguridad académica de las instituciones y garantía del servicio a sus estudiantes.